3CX для Linux = 3CX Elastix. Клиенты одинаковые. Все зависит от используемой инфраструктуры. Если это хостинг - однозначно Linux. Если у вас микроПК - тоже Linux. А если уже есть Windows Server - лучше поставить на него. Кроме того, сейчас Linux версия находится в стадии RC и там еще не все реализовано.