Вам нужно в Б24 настроить ссылки call to (еще -> Настройки -> Другие настройки -> Форматирование) в виде:
Посмотреть вложение 5758
А далее средствами браузера при первом клике по номеру телефона настроить открытие ссылки callto через десктопный клиент.
P.S. Рекомендую рассмотреть нашу интеграцию 3СХ с Б24. Она на несколько порядков лучше штатной интеграции. Точнее сказать, штатная интеграция сделана просто никак и ей почти никто не пользуется, а наша интеграция сделана по уму с множеством настроек и с передачей записей разговоров в Б24. Ознакомиться с нашим решением можно на:
https://razgovor.biz/catalog/liczenzii-3cx/3cx-bitrix24/